Il Dipartimento si occupa della gestione dell'amministrazione, degli affari e dei servizi di carattere generale del Ministero; elabora e promuove azioni e progetti volti ad innovarne l'impianto organizzativo e logistico; contribuisce a sviluppare la flessibilità, l'efficienza e l'efficacia del sistema pubblico di approvvigionamento e migliorare, nel loro complesso, la qualità dei servizi resi, garantendo al tempo stesso l'impiego ottimale delle risorse umane e strumentali di cui dispone.
L'attività istituzionale del Dipartimento lo vede coinvolto nel duplice ruolo di promotore di progetti di rinnovamento dell'intera macchina amministrativa ministeriale e di responsabile della realizzazione di servizi finali rivolti sia all'interno della struttura organizzativa del Ministero, come il presidio delle attività inerenti la gestione del personale, sia all'esterno ad essa, come coordinatore dell'attività delle sedi locali distribuite sull'intero territorio nazionale.
Il Dipartimento supporta infatti l'analisi, la progettazione e la realizzazione del programma di innovazione e modernizzazione del Ministero mettendo a disposizione dell'intera struttura le proprie competenze progettuali e specialistiche organizzate in team interdisciplinari. A tale riguardo è da sottolineare la scelta di favorire, in modo particolare, la creazione di unità di progetto interdipartimentali allo scopo di metterne a frutto la conseguente visione sistemica ed incrementare l'integrazione e la coesione organizzativa tra i Dipartimenti. Inoltre ciascuno dei Servizi e delle Direzioni, nelle quali è organizzato il Dipartimento, provvede ad elaborare strategie di miglioramento organizzativo nell'ambito delle materie di propria competenza interagendo con gli altri Dipartimenti allo scopo di mettere a fattor comune le proprie esperienze creando, laddove gli ambiti lo consentono, integrazione e coerenza metodologica.
La funzione di promotore del programma di innovazione del sistema organizzativo è realizzata in accordo con gli indirizzi strategici dell'autorità politica e attraverso un'attenta analisi delle esperienze e delle scelte effettuate dalla Pubblica Amministrazione su scala nazionale, comunitaria ed internazionale e degli scenari che vi si profilano ponendo particolare attenzione all'importante ruolo istituzionale ricoperto dal Ministero dell'Economia e delle Finanze.
L'attuale struttura organizzative del Dipartimento si articola in Uffici di diretta collaborazione con il Capo Dipartimento, in Servizi e Direzioni Centrali. Le responsabilità del Dipartimento, per ciò che concerne l'aspetto dell'innovazione, e al di là delle competenze istituzionali di ogni singolo Ufficio, Servizio o Direzione, riguardano in particolare: l'elaborazione e la promozione, da parte dell'Ufficio Razionalizzazione Acquisti della PA, delle politiche volte alla razionalizzazione dei sistemi di approvvigionamento di beni e servizi nella Pubblica Amministrazione e la loro modernizzazione tecnologica mediante lo sviluppo dei sistemi di e-procurement.
La realizzazione, da parte dell'Ufficio per il controllo di gestione dipartimentale, di un sistema che fornisca il necessario supporto informativo al processo di programmazione delle attività del Dipartimento, dalla individuazione degli obiettivi alla definizione del budget; l'ufficio si occupa inoltre di supportare la creazione di un sistema unitario di controllo di gestione, che salvaguardando l'autonomia e la specificità dei singoli Dipartimenti, fornisca gli strumenti di monitoraggio dell'impiego delle risorse disponibili complessive del Ministero.
La gestione e l'elaborazione, da parte del Servizio Centrale del personale, delle politiche del personale del Ministero; il servizio cura le relazioni sindacali e presidia i processi di programmazione delle assunzioni, del trattamento giuridico ed economico, della formazione e dello sviluppo del personale ponendo particolare attenzione alla valorizzazione del capitale umano, all'arricchimento delle competenze e all'incremento delle performance individuali e collettive.
La realizzazione, a cura del Servizio Centrale per gli Affari Generali e la qualità dei Processi e dell'Organizzazione, di azioni innovative volte a migliorare l'efficacia, l'efficienza dei servizi finali resi agli utenti interni ed esterni al Ministero, attraverso un'attività di analisi, misurazione e ottimizzazione dei processi, con particolare attenzione a quelli di natura interdipartimentale.
La definizione, da parte del Servizio Centrale per il Sistema Informativo Integrato delle specifiche esigenze funzionali relative agli interventi di informatizzazione realizzati per lo svolgimento dei compiti istituzionali del Dipartimento nell'ambito del sistema informativo integrato del Ministero, l'attività di coordinamento, realizzata dalla Direzione Centrale degli uffici locali e dei servizi del Tesoro, delle Direzioni Provinciali dei Servizi Vari che, nell'ambito dei Dipartimenti provinciali, svolgono in sede locale servizi di competenza del Ministero esercitando le funzioni tecniche ed amministrative connesse alla gestione delle pensioni di guerra, degli assegni vari spettanti a particolari categorie di utenti, all'erogazione dei trattamenti economici a carico del bilancio dello Stato e, mediante convenzione, dei trattamenti economici a carico di altre amministrazioni pubbliche.

